Efiopiyada SARS-COV-2-ni müəyyənləşdirmək üçün dörd nuklein turşusu gücləndirmə təhlili

Təbiət.com ziyarət etdiyiniz üçün təşəkkür edirəm. Məhdud CSS dəstəyi ilə bir brauzer versiyasından istifadə edirsiniz. Ən yaxşı təcrübə üçün yenilənmiş brauzerdən istifadə etməyinizi tövsiyə edirik (və ya Internet Explorer-də uyğunluq rejimini deaktivlik rejimini) tövsiyə edirik. Bundan əlavə, davam edən dəstəyi təmin etmək üçün saytın üslub və JavaScript olmadan göstəririk.
Bir anda üç slaydın bir karuselini göstərir. Bir anda üç slayddan keçmək və ya bir anda üç slayddan keçmək üçün sonunda sürgü düymələrindən istifadə etmək üçün əvvəlki və sonrakı düymələrdən istifadə edin.
2019 Coronavirus Xəstəliyi (COVID-19) başlamışdır, bir çox kommersiya nuklein turşusu gücləndirmə testləri (NAATS) dünyada inkişaf etdirilmiş və standart təhlillər halına gəldi. Bir neçə test testi tez inkişaf etmiş və laboratoriya diaqnostik testlərinə tətbiq olunsa da, bu testlərin performansı müxtəlif parametrlərdə qiymətləndirilməyib. Buna görə, bu araşdırma, Abbott SARS-COV-2, Daan Gene, BGI və Sansure Biotech Assays-ın kompozit istinad standartından (CRS) fəaliyyətini qiymətləndirmək məqsədi daşıyır. Tədqiqat Efiopiya Xalq Sağlamlığı İnstitutunda (EPHI) 1-30 dekabr 2020-ci il tarixlərində keçirilmişdir. 164 nümunədən 59.1% müsbət idi və 40,9% -i CRS üçün mənfi idi. Sansure Biotech pozitivliyi CRS (p <0.05) ilə müqayisədə xeyli aşağı idi. Sansure Biotech pozitivliyi CRS (p <0.05) ilə müqayisədə xeyli aşağı idi. Положительные результаты Sansure Biotech Были значительно ниже по сравнению с CRS (p <0,05). Sansure Biotech-in müsbət nəticələri CRS (P <0.05) ilə müqayisədə xeyli aşağı idi.与 CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低 (p <0.05).与 CRS 相比, Sansure Biotech 的阳性率显着较低 (p <0.05). Sansure Biotech Было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). Sansure Biotech CRS (p <0.05) ilə müqayisədə xeyli müsbət nəticələr azdır.Dörd analizin ümumi razılığı CRS ilə müqayisədə 96,3-100% təşkil etmişdir. Sansure Biotech ASSAY'nın aşağı pozitiv dərəcəsinə əlavə olaraq, dörd listanın performansı təxminən müqayisə olundu. Beləliklə, Sansure Biotech [Yalnız Tədqiqat YALNIZ (RUO)] ASSAY Efiopiyada istifadəsi üçün əlavə təsdiq tələb edir. Nəhayət, müvafiq istehsalçının iddiaları ilə təhlilləri qiymətləndirmək üçün əlavə tədqiqatlar nəzərə alınmalıdır.
Laboratoriya testi Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatının (Kim) Koronavirus Xəstəliyi üçün Strateji Planının (Covid-19) hazırlığı və cavabı (SPRP) bir hissəsidir. Bu ölkələrin hazırlığı, düzgün iş idarəçiliyini, ayıqlığı və ictimai sağlamlıq problemlərinə sürətli cavab vermək üçün laboratoriya qabiliyyəti yaratmaları barədə kim tövsiyə edir. Bu, laboratoriyanın rolunun ortaya çıxan yoluxucu maddələrin xəstəliyini və epidemiologiyasını xarakterizə etmək və yayılmalarının idarə edilməsinin açarı olduğunu göstərir.
Covid-19 diaqnozu epidemioloji və tibbi məlumatlar, şəxsi simptomlar / işarələr və rentgenoqrafik və laboratoriya məlumatları tələb edir. COVID-19 başlamış, Çində Wuhan, bir çox ticari nuklein turşusu gücləndirmə testləri (NAATS) dünyada inkişaf etdirildi. Real vaxt rejiminin tərs transkripsiyası polimeraz zəncirvari reaksiya (RRT-PCR) şiddətli kəskin tənəffüs sindromu 2 (SARS-COV-2) 3 infeksiyası laboratoriya diaqnozu üçün adi və standart bir metod kimi istifadə edilmişdir. SARS-COV-2-nin molekulyar aşkarlanması adətən N (nukleocapsid protein geninin), e (zərf protein gen) və orf1a / b-də RDRP (rna asılı rna polkeraz gen) genləri (Açıq oxu çərçivəsi 1A / B) əsaslanır. gen) viral genomdan müəyyən edilmiş bölgə. Virus tanıma üçün viral genomlarda tapılan əsas qorunan bölgələr hesab olunurlar4. Bu genlər arasında RDRP və E Genləri arasında yüksək analitik aşkarlama həssaslığı var, n geninin aşağı analitik həssaslığı5 var.
PCR Layterlərinin performansı, excraftion reagentləri, gücləndirmə / aşkarlama reagentləri, hasilat metodu, PCR maşın və digər alətlərin keyfiyyəti, hasilat metodu, keyfiyyəti olanlar. 2020-ci ilin aprel ayında doqquz ölkədən 48-dən çox müxtəlif diaqnostik cihaz, Covid-196 diaqnostikası üçün təcili istifadə icazəsi (EUA) alınıb. Efiopiyada, Abi 7500, Abbott M2000, Roche 48000, Roche 48000 və Quant-Studio7, Abbott M2000, Roche 48000 və 58000-də SARS-COV-2-də PCR-COV-2-nin PCR-in pkr patronu istifadə olunur. Bundan əlavə, Daan Gene testi, Abbott Sars-Cov-2 testi, Sans-Cov-2 Bgi testi kimi müxtəlif PCR test dəstləri mövcuddur, məsələn, Abbott Sars-Cov-2 testi, Sans-Cov-2 Bgi testidir. RRT-PCR yüksək həssas olsa da, Covid-19 olan bəzi xəstələr, düzgün hesabat, nəqliyyat, saxlama və rəftar və laboratoriya testi səbəbiylə viral ribonuklein turşusunun (RNT) nüsxələrinin çatışmazlığı səbəbindən yalan mənfi nəticələr verirlər. personalın şərtləri və hərəkətləri8. Bundan əlavə, nümunə və ya nəzarət mishandling, velosiped həddi (CT) qəbulu və digər patogen nukleik turşuları və ya hərəkətsiz / qalıq SARS-COV-2 RNT ilə RNT-nin saxta müsbət nəticələrə səbəb ola bilər. Beləliklə, PCR testləri həqiqətən də gen fraqmentlərinin daşıyıcılarını tanıya biləcəyi aydındır, çünki həqiqətən aktiv viral genləri ayırd edə bilmirlər, buna görə testlər yalnız daşıyıcıları yalnız daşıyıcıları müəyyənləşdirə bilər. Buna görə, qəbulumuzdakı standart metodlardan istifadə edərək diaqnostik performansını qiymətləndirmək vacibdir. Bir çox Naat reagentləri Efiopiya Xalq Sağlamlığı İnstitutunda (EPHI) və ölkə daxilində, effektivliyinin heç bir müqayisəli qiymətləndirilməsini hələ də bildirdi. Buna görə, bu araşdırma, SARS-COV-2-nin aşkarlanması üçün COD-PCR-in, klinik nümunələrdən istifadə edərək, SARS-COV-2-nin aşkarlanması üçün kommersiya baxımından müqayisəli performansını qiymətləndirməyə yönəldilmişdir.
Covid-19 şübhəli ilə cəmi 164 iştirakçı bu işə daxil edildi. Nümunələrin əksəriyyəti müalicə mərkəzlərindən idi (118/164 = 72%), qalan 46 (28%) iştirakçı isə qeyri-müalicə mərkəzlərindən idi. Mərkəzdə müalicə olunmayan iştirakçılar arasında 15 (9.1%) klinik olaraq şübhəli hallar və 31 (18,9%) təsdiqlənmiş işlərlə əlaqəli olmuşdur. Doxsan üç (56,7%) iştirakçılar kişi idi və iştirakçıların orta (± SD) yaşı 31.10 (± 11.82) il idi.
Bu araşdırmada, Covid-19 üçün dörd testin müsbət və mənfi dərəcələri müəyyən edilmişdir. Beləliklə, Abbott Sars-Cov-2 ASSAY, DAAN Gene 2019-NCOV ASSAY, SARS-COV-2 BGI ASSAY və Sansure Biotech 2019-NCOV ASSAY-in müsbət qiymətləri 59,1%, 58,5%, 57.9%, 55,9% və 55.5%, 57.5% və 55.5% və 55,9% və 55.5% və 55.5% və 55.5%, Müsbət və mənfi kompozit istinad standartı (CRS) balları 97 (59,1%) və 67 (40,9%), müvafiq olaraq (Cədvəl 1) idi. Bu araşdırmada, CRS tərifi "hər hansı bir müsbət" qaydasına əsaslanır, bununla da dörd test nəticəsindən, eyni nəticəni verən iki və ya daha çox test nəticəsi əsl müsbət və ya mənfi hesab olunurdu.
Bu araşdırmada, CRS ilə müqayisədə bütün təhlillər üçün 100% (95% CI 94.6-100) mənfi faiz sazişi (95% CI 94.6-100) tapdıq. Sansure Biotexnologiya analizi 93,8% (95% CI 87.2-97.1) minimum PPA-nı (95% CI 87.2-97.1) göstərdi və 2019-NCOV təhlili 99.4% (95% CI 96.6-99.9) ümumi bir razılaşma oldu. Bunun əksinə olaraq, SARS-COV-2 Bgi ASSAY və Sansure Biotech 2019-NCOV ASSAY ilə müqayisədə ümumilikdə 98,8%, 96,3%, müvafiq olaraq (Cədvəl 2).
Cohen'in Kappa Kappa, CRS və Abbott SARS-COV-2 ASSAY nəticələri arasında razılaşma əmsalı tam ardıcıl idi (K = 1.00). Eynilə, Daan Gene 2019-NCOV, SARS-COV-2 BGI və Sansure Biotech 2019-NCOV tərəfindən aşkar edilmiş Kappa dəyərləri də CRS (K ≥ 0.925) də tam uyğundur. Bu müqayisəli analizdə, Chi-Meydanın testi (McNeMar testi), Sansure Biotech 2019-NCOV ASSAY nəticələri CRS nəticələrindən əhəmiyyətli dərəcədə fərqləndiyini göstərdi (P = 0.031) (Cədvəl 2).
Şəkildə göstərildiyi kimi.1 Abbott Sars-COV-2 ASSAY-ın ən aşağı CT dəyərinin (<20 CT) faizi (birləşdirilmiş RDRP və N gen) faizi 87,6%, Sansure Biotech 2019-NCOV ASSE-nin (<20 CT) faizi 50,3% (36-40 CT) 3,2% olmuşdur. 1 Abbott Sars-COV-2 ASSAY-ın ən aşağı CT dəyərinin (<20 CT) faizi (birləşdirilmiş RDRP və N gen) faizi 87,6%, Sansure Biotech 2019-NCOV ASSE-nin (<20 CT) faizi 50,3% (36-40 CT) 3,2% olmuşdur.Şəkildə göstərildiyi kimi.1, процент наименьшего значения CT (<20 ct) Анализа Abbott Sars-Cov-2 (Комбинированный ген rdrp и n) составил 87,6%, а значение CT Гена Orf1a / b Анализа Sansure Biotech 2019-Ncov показало показало показало показало показало постачения CT (<20 ct) составлял 50,3%, а высокое значение CT (36-40 ct) Составляло 3,2%. 1, Abbott SARS-COV-2-nin (<20 CT) analizinin faizi 87,6% (<20 CT) analizi 87,6%, Sansure Biotech 2019-NCOV-un Orf1a / B geninin CT dəyəri (<20 CT) 50,3% (36-40 CT) hesabı ilə nəticələndiyini göstərdi 3.2%.如图 1 所示, Abbott Sars-Cov-2 检测 (结合 RDRP 和 N 基因 n 基因 n 基因) 的最低 Ct 值百分比 Şəkil 1-də göstərildiyi kimi, Abbott Sars-COV-2 testinin ən aşağı CT dəyəri (<20 CT) 87,6%, Sansure Biotech 2019-NCOV testinin (<20 ct) -in yüzdə 50,3%, 高 CT 值 (36-40 ct) 3.2%. Как показано на рисунке 1, Анализ Abbott Sars-Cov-2 (сочетающий гены rdrp и n) имел самое низкое процентное значение значение ct (<20 ct) 87,6%, a значение ct гена orf1a / b в исследовании Sansure Biotech 2019- Анализ Ncov показал показал показал показал показал показал показал показал показал показал показал показал показал Şəkil 1-də göstərildiyi kimi, Abbott SARS-COV-2 ASSay (RDRP və N Genləri birləşdirən) ən aşağı faizi CT dəyəri 87,6% (<20 CT), Sansure Biotech 2019 Tədqiqatında CT dəyəri olan Ncovun təhlili aşağı CT göstərdi. Процент значений (<20 ct) составил 50,3%, а прцент высоких значений ct (36-40 ct) составил 3,2%. Dəyərlərin faizi (<20 CT) 50,3%, yüksək CT dəyərlərinin (36-40 ct) faizi 3,2% təşkil etmişdir.Abbott SARS-COV-2 B testi 30-dan yuxarı CT dəyərlərini qeyd etdi. Digər tərəfdən, Bgi SARS-COV-2 ASSAY Orf1a / B Gene yüksək CT dəyəri (> 36 CT) faizi 4% (Şəkil 1) idi. Digər tərəfdən, Bgi SARS-COV-2 ASSAY Orf1a / B Gene yüksək CT dəyəri (> 36 CT) faizi 4% (Şəkil 1) idi. С другой стороны, v Digər tərəfdən, BGI SARS-COV-2 generinin analizində Orf1a / B yüksək CT dəyəri (> 36 CT), faizi 4% (Şəkil 1) idi.另一方面, 在 Bgi SARS-COV-2 检测 检测 检测 检测 检测 检测 检测 检测 基因具高 高 基因具 高 高 Ct 值 (> 36 CT) 的百分比为 4% (图 1). Digər tərəfdən, BGI SARS-COV-2 təsbitində, yüksək CT dəyəri (> 36 CT) olan Orf1a / B gen faizi 4% (Şəkil 1). С другой стороны, v Digər tərəfdən, BGI SARS-COV-2 analizində, yüksək CT dəyərləri (> 36 CT) olan Orf1a / B genlərinin faizi 4% (Şəkil 1) idi.
Bu araşdırmada 164 nasosuğiz nümunəsi aldıq. Bütün növ təhlillər üçün RNT izolyasiyası və gücləndirmə müvafiq istehsalçılar tərəfindən tövsiyə olunan metod və dəstlərdən istifadə edərək həyata keçirildi.
Bu araşdırma, Abbottun SARS-COV-2 üçün testinin CRS, 100% müsbət, mənfi və ümumi bir uyğunlaşma ilə eyni təsbit performansına sahib olduğunu nümayiş etdirdi. Cohen'in Kappa Sazişi 1.00, CRS ilə tam razılaşmanı göstərir. ABŞ-da Vaşinqton Universiteti tərəfindən oxşar bir araşdırma, SARS-COV-2 üçün Abbott testinin ümumi həssaslığı və spesifikliyinin CDC-nin laboratoriya tərəfindən müəyyən edilmiş ASSAY (LDA) ilə müqayisədə 93% və 100% oldu. 11. Abbott SARS-COV-2 aşkarlama sistemi N və RDRP genlərinin eyni vaxtda birləşdirilmiş aşkarlanmasına əsaslanır, çünki hər iki gen daha həssasdır, çünki saxta neqativləri minimuma endirir. Vyanada bir araşdırma, Avstriya da böyük hasilat nümunəsi həcminin və aşkarlanması ilə örtülü həcmlərin azaldılması effektlərini minimuma endirdi və aşkarlama effektivliyi13. Beləliklə, Abbott-un SARS-COV-2 ASSAY üçün mükəmməl bir matç eyni vaxtda birləşmə genləri aşkar edən bir platforma aşkarlama sistemi ilə əlaqələndirilə bilər, çox sayda nümunə (0,5 ml) çıxarır və çox sayda euent (40 mkl) istifadə edir.
Nəticələrimiz də göstərdi ki, Daan genetik testinin aşkarlanması performansı demək olar ki, CRS ilə eyni idi. Bu, Huainan, Çində Anhui Universitetində aparılan bir tədris14 ilə ardıcıldır və istehsalçının 100% müsbət razılaşma iddiası. Ardıcıl nəticələr barədə hesabatlara baxmayaraq, eyni yorğunu yenidən sınamaqdan sonra bir nümunə saxta idi, lakin Abbott SARS-COV-2 və Sansure Biotech NCOV-2019-ı suallarda müsbət idi. Bu, müxtəlif növ təhlillərin nəticələrində dəyişkənlik ola biləcəyini göstərir. Buna baxmayaraq, Çin15-də edilən işdə Daan Gene ASSAY-ın nəticəsi laboratoriya tərəfindən təyin olunan təhlil ilə müqayisədə əhəmiyyətli dərəcədə fərqli idi (p <0.05). Buna baxmayaraq, Çin15-də edilən işdə Daan Gene ASSAY-ın nəticəsi laboratoriya tərəfindən təyin olunan təhlil ilə müqayisədə əhəmiyyətli dərəcədə fərqli idi (p <0.05). Bəli, в исследовании, в исследовании, проведенном в Китае15, Результат Анализа Daan Gene Значительно отличался (p <0,0,05) от их Лабораторного эталонного Анализа. Bununla birlikdə, Çin15-də bir araşdırmada, Daan Gene'nin analiz nəticəsi laboratoriya istinad təhlilindən əhəmiyyətli dərəcədə fərqli idi (p <0.05).然而, 在 国进行的研究国进行的研究 中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比 有 显着差异 (p <0.05).然而, 在 国进行的研究国进行的研究 中 15, 大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比 有 显着差 <0.05 Однако в исследовании, проведенном в китае15, Результаты генетического теста Daan значительно отличались (p <0,05) по Сравнению Его эталонным Лабораторным тестом. Bununla birlikdə, Çinin 15-də bir araşdırmada, Daanın genetik testinin nəticələri, istinad laboratoriyası testi ilə müqayisədə əhəmiyyətli dərəcədə fərqli idi (p <0.05).Bu uyğunsuzluq, SARS-COV-2-i aşkar etmək üçün istinad testinin həssaslığı ilə əlaqədar ola bilər və sonrakı tədqiqatlar səbəbi müəyyənləşdirmək üçün vacib ola bilər.
Bundan əlavə, araşdırmamız SARS-Cov-2 Bgi ASSay ilə müqayisəli performansını CRS ilə müqayisəli performansını, əla müsbət faiz sazişi (PPA = 97.9%), mənfi faiz sazişi (NPA = 100%) və cinsiyyət (OPA) tərəfindən ümumi faiz sazişi göstərir. ). = 98.8%). Cohen'in Kappa dəyərləri yaxşı bir razılaşma göstərdi (K = 0.975). Hollandiya16 və China15-də tədqiqatlar ardıcıl nəticələr göstərdi. SARS-COV-2 BGI testi 10 mkl gücləndirmə / aşkarlama istifadə edərək bir gen (orf1a / b) aşkarlama testidir. İstinad nəticələrimizlə yaxşı statistik razılığa baxmayaraq, analiz ümumi nümunənin iki müsbət nümunəsini (1.22%) qaçırdı. Bu, həm xəstə, həm də icma səviyyəsində ötürmə dinamikası üçün böyük klinik təsirləri ola bilər.
Bu araşdırmaya daxil olan başqa bir müqayisəli analiz, Sansure Biotech NCOV-2019 RRT-PCR (RUO) ASAY; Ümumi matçın faizi 96,3% təşkil etmişdir. Razılaşmanın gücü, CRS ilə tam razılaşmanı göstərən Cohenin Kappa dəyəri ilə də müəyyən edildi. Yenə də nəticələrimiz, Changsha, Çin şəhərində və Liuzhou Cins Xəstəxanasının Klinik Laboratoriya şöbəsində, Liuzhou City, China17-də edilən işlər Yuxarıda göstərilən yaxşı statistik bir razılığın qeydə alınmasına baxmayaraq, Chi-kvadrat testi (Macnemar testi), Sansure Biotech ASSAY'nın nəticəsi CRS (p <0.005) ilə müqayisədə statistik cəhətdən əhəmiyyətli bir fərq olduğunu göstərdi. Yuxarıda göstərilən yaxşı statistik bir razılığın qeydə alınmasına baxmayaraq, Chi-kvadrat testi (Macnemar testi), Sansure Biotech ASSAY'nın nəticəsi CRS (p <0.005) ilə müqayisədə statistik cəhətdən əhəmiyyətli bir fərq olduğunu göstərdi. Несмотря на то, Что было зафиксировано Указанное выше вышее статистическое соответствие, Критерий хи-Квадрат (Критерий макнемара) показал, что результат Анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005). Yuxarıda olan yaxşı statistik saziş qeydə alsaq da, Chi-Meydanın testi (McNeMar testi), Sansure Biotech ASSAY'nın nəticəsi CRS (p <0.005) ilə müqayisədə statistik cəhətdən əhəmiyyətli bir fərq olduğunu göstərdi.尽管记录了上述良好的统计一致性, 但卡方检验, 但卡方检验 (Macnemar 检验) 表明, Sansure Biotech 检测的结果与 CRS 相比具相比具 统计学显着差异 (p <0.005).尽管 记录 了 上述 上述 良好 一致性 一致性 一致性 一致性 一致性 一致性 一致性 ((Macnemar 检验检验 ,,, Sansure Biotech 检测 结果 结果 CRS 相比 具相比 具 ((p <0.005 ......................))))))) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (Критерий макнемара) показал Статистически значически значимую разницу (p <0,005) между Анализом Sansure Biotech və CRS. Yuxarıda qeyd olunan yaxşı statistik razılaşmaya baxmayaraq, Chi-Meydanın testi (McNeMar testi) Sansure Biotech ASSAY və CRS arasında statistik cəhətdən əhəmiyyətli bir fərq göstərdi (p <0.005).Altı nümunə (3.66%) CRS-ə nisbətən yalan mənfi cəhətləri (əlavə cədvəl 1); Bu, xüsusən virusun ötürülməsinin dinamikasını nəzərə alaraq çox vacibdir. Yuxarıdakı məlumatlar da bu aşağı aşkarlama dərəcəsini dəstəkləyir15.
Bu işdə CT dəyərləri hər bir təhlil və müvafiq platforma üçün müəyyən edilmiş, ən aşağı orta CT dəyəri olan Abbott SARS-COV-2 ASSay-da bildirildi. Bu nəticə, SARS-COV-2-nin aşkarlanması üçün Abbottun eyni vaxtda birləşdirilmiş genetik sınaq sistemi ilə əlaqəli ola bilər. Buna görə, Şəkil 1-ə görə, ABBOTT SARS-COV-2 nəticələrinin 87,6% -i 20-dən aşağı CT dəyərləri var. 30-dan yuxarı CT dəyərləri qeydə alınmadı. Abbott-ın SARS-COV-2 panelinin genetik test formatından istifadə edilməsi ilə yanaşı, bu nəticə ən aşağı aşkarlama limiti (32.5 rna nüsxə / ml) 18, bu, 100 RNT nüsxəsinin / ml-in aşağı həddindən üç dəfə aşağı olan 18-dən aşağı olanı ilə əlaqəli ola bilər. ml) 19.
Bu araşdırmada bəzi məhdudiyyətlər var: Birincisi, resursların olmaması səbəbindən standart / istinad üsulları, ya da viral yük və ya digər laboratoriya testləri (LDA)] yoxdur. İkincisi, bu işdə istifadə olunan bütün nümunələr nasofaringeal köpüklər idi, nəticələr digər nümunələrə və üçüncülərə tətbiq olunmadı, üçüncüsü ölçüsü kiçik idi.
Bu araşdırma, Nasofarygeal nümunələrindən istifadə edərək SARS-COV-2 üçün dörd RRT-COV-2-nin performansını müqayisə etdi. Sansure Biotech ASSAY istisna olmaqla, bütün aşkar edilməsi təhlilləri təxminən müqayisə olunan performansa sahib idi. Bundan əlavə, CRS (p <0.05) ilə müqayisədə Sansure Biotech ASSAY-də aşağı pozitiv dərəcəsi müəyyən edilmişdir. Bundan əlavə, CRS (p <0.05) ilə müqayisədə Sansure Biotech ASSAY-də aşağı pozitiv dərəcəsi müəyyən edilmişdir. Кроме того, в тесте в тесте в тесте в тесте в тесте sansure был вылевлен низкий прцент положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,0,05). Bundan əlavə, Sansure Biotech testi CRS (p <0.05) ilə müqayisədə müsbət nəticələrin aşağı olduğunu göstərdi.此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低 (p <0.05).此外, 与 CRS 相比, Sansure Biotech 检测的阳性率较低 (p <0.05). Кроме того, Анализ Sansure Biotech Имел Более Более Более Более Более болеен положительных результатов по сравнению с CRS (p <0,05). Bundan əlavə, Sansure Biotech ASSAY CRS (p <0.05) ilə müqayisədə daha aşağı müsbətlik dərəcəsi var idi.Sansure Biotech NCOV-2019 (Ruo) PPA, NPA və ümumilikdə razılaşma 93,5% -i 93,5% -i, müqavilə dəyəri 0.925-in cohen kappa gücü ilə 93,5% -i keçdi. Nəhayət, Sansure Biotech ASSAY (RUO) Efiopiyada istifadə üçün daha da təsdiqlənməyə ehtiyac duyur və fərdi istehsalçıların iddialarını qiymətləndirmək üçün əlavə tədqiqatlar nəzərə alınmalıdır.
Müqayisəli tədqiqat dizaynı ADDIS Ababa, Eka Kotebe Xəstəxanasında, Minilliyin Kilsə müalicə mərkəzi, Zewooditu Memorial Xəstəxanası və Müqəddəs Peterin vərəm mütəxəssisi Mütəxəssisi Xəstəxanası. Məlumatlar 1 və 31 dekabr 2020-ci illər arasında toplanmışdır. Bu iş üçün tibb müəssisələri, çox sayda işlərinə və şəhərdəki böyük müalicə mərkəzlərinin mövcudluğu əsasında məqsədyönlü şəkildə seçildi. Eynilə, Abi 7500 və Abbott M2000 real vaxt pcl alətləri daxil olmaqla alətlər Naat reagent istehsalçılarının tövsiyələrinə uyğun olaraq seçildi və bu iş üçün dörd pverte aşkar dəst seçildi, çünki Efiopiyada ən azı dörd nəfərin ən azı dördü istifadə etdi. Gene testi, Abbott Sars-Cov-2 testi, Sansure Biotech testi və SARS-COV-2 BGI testi iş zamanı ifa etdi).
SARS-COV-2 üçün sınaq 1-dən 30 dekabr 2020-ci il tarixlərində 3 ml viral nəqliyyat vasitəsi (Mirclean texnologiyası, Shenzhen, Çin), Covid-19 üçün istintaq başlatdığı şəxslərdən istifadə edərək Ephi'yi istinad etdi. Nasosharingeal nümunələri təlim keçmiş nümunə kolleksiyaçıları tərəfindən toplanmış və üçlü paketlərdə Ephi-yə göndərilmişdir. Nuklein turşusu izolyasiyasından əvvəl, hər bir nümunəni unikal şəxsiyyət nömrəsi verilir. Hasilatı əl ilə və avtomatik hasilat metodlarından istifadə edərək hər bir nümunədən dərhal sonra həyata keçirilir. Beləliklə, Abbott M2000-in avtomatik çıxarılması üçün, nümunənin 1,3 ml, 0,8 ml, 0,8 ml həcmi və 0,5 ml hasilat həcmi daxil olmaqla) hər nümunədən çıxarıldı və Abbott DNA nümunəsi hazırlığı sistemi (Abbott Molecular Inc. Des Plaines, IL, ABŞ) keçdi. ) 96 [92 nümunə, iki aşkarlama nəzarəti və iki şablon olmayan nəzarət (NTC)) bir dəstə, real vaxtda SARS-COV-2 (EUA) iki turun ümumi prosesinə (axtarış və aşkar edilməsi) daxil edilmişdir. Mədənçıxarma. Eynilə, əl hasilatı üçün eyni nümunələrdən istifadə edin (avtomatik çıxarış və kəşf üçün). Beləliklə, proses boyunca, 140 mkl nümunələri qəbul edilmiş və doqquz turdan 24-ü (20 nümunə, iki analiz nəzarət və iki NTC) qruplarında qiamam viral rna mini kit (qiagen GmbH, Hilden, Hilden, Almaniya) istifadə edərək əldə edilmişdir. Əl ilə çıxarılan euates, SARS-COV-2 Bgi Assay, Daan Gene Alaray və Sansure Biotech ASAY-dan istifadə edərək Abi 7500 istilik siklerindən istifadə edərək gücləndirildi və aşkarlandı.
SARS-COV-2 Viral RNT-nin avtomatlaşdırılmış təcrid və təmizlənməsi Abbott DNA nümunə hazırlıq reagentlərindən istifadə edərək maqnit boncuk prinsipini izləyir. Nümunələrin və viral hissəciklərin həll edilməməsi, zülal və inaktivat rnase densoru olan Guanidine İyothiosyate olan bir yuyucu vasitə istifadə edərək həyata keçirilir. RNT, daha sonra Silisiumdan istifadə edərək bərk faza ayrılması ilə proteindən ayrılır, yəni guanidinium duzu və lizf buferinin qələvi pH-nin siliks turşularının bağlamasını silisiumuna (Sio2) artırır. Durulting addımı açıq bir həll hazırlamaq üçün qalan zülallar və zibilləri aradan qaldırır. Şəffaf RNT, alətin maqnit sahəsi 20,21 istifadə edərək silisium əsaslı mikropartikllərdən təcrid olunmuşdur. Digər tərəfdən, RNT-nin əl ilə izolyasiyası və təmizlənməsi, maqnit stenti əvəzinə sentrifugation istifadə edərək spin sütun üsulu ilə aparılır.
Abbott Real-time SARS-COV-2 aşkarlama testi (Abbott Molekulyar, Inc), İstehsalçının göstərişinə görə, kimin və FDA-dan EUA19,22-ni qəbul edən istehsalçının göstərişlərinə uyğun olaraq həyata keçirildi. Bu protokolda, hasilatdan əvvəl nümunə inaktivasiya 30 dəqiqə ərzində 56 ° C-də su banyosunda aparıldı. Virusun inaktivasiyasından sonra, bir Abbott M2000 DNT nümunəsi hazırlama sistemindən istifadə edərək 0,5 ml VTM-dən bir Abbott M2000 SP alətində nukleik turşu hasilatı edildi. istehsalçıya görə. Abbott M2000 RT-PCR aləti istifadə edərək gücləndirmə və aşkarlama aparıldı və RDRP və n genləri üçün ikili aşkarlama edildi. ROX) və VIC P (mülkiyyət boyası) daxili nəzarətin hədəflənməsi və aşkarlanması, hər iki gücləndirmə məhsullarının eyni vaxtda aşkarlanmasına imkan verən 19.
Bu dəstin gücləndirmə aşkarlanması metodu bir pilləli RT-PCR texnologiyasına əsaslanır. Orf1a / B və n genləri, Hədəf Bölgəsi gücləndirilməsini aşkar etmək üçün Daan Gene texnologiyası tərəfindən qorunan bölgələr kimi seçilmişdir. Xüsusi astarlar və flüoresan zondları (NDO-ni VIC ilə etiketli olan ORF1A / B probları ilə etiketlənmiş N Gene zondları, Nümunələrdə SARS-COV-2 RNT-ni aşkar etmək üçün hazırlanmışdır. Sonu və usta qarışıqları, 5 mkl 5 mkl, 20 mkl-a qədər olan magistr qarışığının son həcminə əlavə 25 mkl əlavə etməklə hazırlanmışdır. Abi 750024 real vaxt pcl alətində eyni vaxtda amplikifikasiya və aşkar edilməsi edildi.
Orf1a / B və n genləri, Sansure Biotech NCOV-2019 Nuklein turşusu Diaqnostik dəsti (flüoresan PCR aşkarlanması) istifadə edərək aşkar edilmişdir. O Orf1a / B bölgəsi və N Gen üçün ROX kanalı üçün Fam kanalını seçərək hər hədəf gen üçün xüsusi zondlar hazırlayın. Bu ASSAY KİT, EUENT və Master Mix reagentləri aşağıdakı kimi əlavə olunur: 30 μL master qarışığı reaktivi və aşkarlanması / gücləndirilməsi üçün 20 mkl elited nümunə hazırlayın. Real vaxtlı PCR Abi 750025 gücləndirmə / aşkarlama üçün istifadə edilmişdir.
SARS-COV-2 BGI testi, Covid-19 diaqnozu üçün flüoresan real vaxt rejimində RRT-PCR dəstidir. Hədəf bölgəsi, SARS-COV-2 Genomunun Orf1a / B bölgəsində, bir gen aşkarlama metodu olan SARS-Cov-2 Genom-da yerləşir. Bundan əlavə, insan ev sahibi gen act-Actin daxili tənzimlənən hədəf gendir. Master Mix, magistr qarışıq reaktivinin 20 mkl və hasil olunan RNT nümunəsinin 10 mkl-ni bir quyuda 26 qarışdıraraq hazırlanır. Abi 7500 flüoresan kəmiyyət real vaxt rejimində PCR aləti, gücləndirmə və aşkar etmək üçün istifadə edilmişdir. Bütün nuklein turşusu gücləndirilməsi, hər bir təhlil üçün PCR run şərtləri və nəticələrin təfsiri müvafiq istehsalçının təlimatlarına görə yerinə yetirildi (Cədvəl 3).
Bu müqayisəli analizdə, dörd analiz üçün faiz razılaşmasını (müsbət, mənfi və ümumi) və digər müqayisə parametrlərini müəyyənləşdirmək üçün istinad standart metodundan istifadə etmədik. Hər bir test müqayisəsi CRS ilə aparıldı, bu araşdırmada CRS-lər üçün "hər hansı bir müsbət" qayda olaraq təyin edildi və nəticə bir test ilə deyil, ən azı iki uyğun test nəticələrini istifadə etdik. Bundan əlavə, COVID-19 ötürülməsi halında, saxta mənfi nəticələr saxta müsbət nəticələrdən daha təhlükəlidir. Buna görə, bir CRS nəticəsindən mümkün qədər dəqiq bir şəkildə "müsbət" demək üçün ən azı iki ASSAY testi müsbət olmalıdır, yəni ən azı bir müsbət nəticənin bir EUA ASAY-dan gəlməsi ehtimalı var. Beləliklə, dörd test nəticəsindən, eyni nəticəni verən iki və ya daha çox test nəticələri əsl müsbət və ya mənfi hesab olunur18,27.
Məlumatlar qurulmuş məlumatların çıxarılması formalarından istifadə edərək toplanmışdır, məlumatların daxil olması və təhlili təsviri statistika üçün Excel Statistik Proqramı və SPSS versiyası 23.0 istifadə edərək həyata keçirilmişdir. Pozitiv, mənfi və ümumi faizi təhlil edildi və CRS ilə hər metodun razılığı dərəcəsini təyin etmək üçün Kappa hesabı istifadə edildi. Kappa dəyərləri aşağıdakı kimi şərh olunur: mülayim razılıq üçün 0,01 ilə 0.20, ümumi razılaşma üçün 0,21-0.60, orta müqavilə üçün 0.41-0.60, 0.61-0.80 və 0.61-0.99.
Etik rəsmiləşdirmə Əlavə Ababa Universitetindən alındı ​​və bu iş üçün bütün eksperimental protokollar Efiopiya Xalq Sağlamlığı İnstitutunun Elmi Etika İcmal Şurası tərəfindən təsdiq edilmişdir. EPHI etika lisenziyası üçün istinad nömrəsi EPHI / IRB-279-2020-dir. Bütün üsullar, Kovid-19-ın müalicəsi üçün Efiopiya Milli Hərtərəfli Təlimatlarının tövsiyələrinə və müddəalarına uyğun olaraq tətbiq edilmişdir. Bundan əlavə, yazılı məlumatlı razılıq, iş iştirakçılarından əvvəl iş iştirakçılarından alındı.
Bu işdə əldə edilən və ya təhlil edilmiş bütün məlumatlar bu dərc olunan məqaləyə daxil edilmişdir. Bu işin nəticələrini dəstəkləyən məlumatlar müvafiq müəllifdən məqbul tələbi ilə mövcuddur.
Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı. COVID-19 üçün laboratoriya test strategiyaları üçün tövsiyələr: aralıq rəhbərliyi, 21 Mart 2020-ci illər 2020-ci il. Kim / 2019-NCOV / Lab_Testing / 2020.1 (Kim, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Smart Diaqnozu Təcili yardım şöbəsində: Təcrübədə. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, Ki Covid-19 Smart Diaqnozu Təcili yardım şöbəsində: Təcrübədə.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. və Gurgulianis, Ki-nin Ağıllı Diaqnozu Təcili yardım şöbəsində, hər şey praktikada.Muliou DS, Pantazopoulos I. və Gurgulyanis Ki Fövqəladə Bölmələrdə Covid-19-ın ağıllı diaqnozu: Təcrübədə sona çatmağı sona çatdırmaq. Ekspert hörmətli cavab. dərman. 3, 263-272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Covid19 ID-nin qiymətləndirməsi İndi EUA ASAY. Mitchell, SL & St George, K. Covid19 ID-nin qiymətləndirməsi İndi EUA ASAY.Mitchell, SL və St. George, K. Covid19 ID-nin qiymətləndirməsi İndi EUA ASAY.Mitchell SL və St. George K. Covid19 ID-nin qiymətləndirməsi İndi EUA ASAY. J. Klinik. Virus. 128, 104429. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
ÜST. Koronavirus xəstəliyinin laboratoriya aşkarlanması, şübhəli insan xəstəliyidə 2019 (COVID-19). https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (15 avqust 2020-ci illərdə daxil olmaq) (kim, 2020).
Udugama, B. et al. Covid-19 Diaqnozu: Xəstəliklər və sınaq vasitələri. ACS Nano 14 (4), 3822-3835 (2020).
Syed S. et al. Şərq, Mərkəzi və Cənubi Afrika Patholoqları Kollecinin yaradılması - Yaxın Şərq və Cənubi Afrika Regional Patologiyası Məktəbi. Afrika. J. Lab. dərman. 9 (1), 1-8 (2020).
Efiopiya Xalq Sağlamlığı İnstitutu, Federal Səhiyyə Nazirliyi. İnterim Milli Strategiya və Covid-19 laboratoriya diaqnozu üçün rəhbərlik. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/ephi_pheoc_covid-19_laboratory_diagnosis_eng.pdf (12 avqust 2020-ci il) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, SARS-COV-2 infeksiya problemləri və təsiri üçün saxta mənfi testlər kimi. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, SARS-COV-2 infeksiya problemləri və təsiri üçün saxta mənfi testlər kimi.Voloshin S., Patel N. və Kesselheim SARS-COV-2 infeksiyası və nəticələrini yalan-mənfi testlər kimi.Voloshin S., Patel N. və Kesselheim, təxribat və SARS-COV-2 infeksiyasının təsiri üçün saxta mənfi testlər kimi. N. Eng. J. Tibb. 383 (6), E38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki saxta-müsbət və yalan-mənfi Covid-19 hadisələri: tənəffüsün qarşısının alınması və idarəetmə strategiyaları, aşılama və sonrakı perspektivlər. Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki saxta-müsbət və yalan-mənfi Covid-19 hadisələri: tənəffüsün qarşısının alınması və idarəetmə strategiyaları, aşılama və sonrakı perspektivlər. Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki Ложнополоительные и Ложноотрицательные случаи Covid-19: Респираторная профилактаика и стратегии лечения, Вакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, Ki-nin saxta müsbət və yalançı mənfi hadisələri: tənəffüsün qarşısının alınması və müalicə strategiyaları, peyvənd və irəli yol.Muliu, DS və Gurgulianis, Ki-nin saxta-müsbət və saxta-mənfi halları: tənəffüsün qarşısının alınması və müalicəsi, peyvənd və irəli yol üçün strategiyalar. Ekspert hörmətli cavab. dərman. 15 (8), 993-1002 (2021).
Mouliou, DS, ioannis, P. & konstantinos, G. Covid-19 diaqnozu Təcili yardım şöbəsində: ağacı görərək meşəni itirir. Mouliou, DS, ioannis, P. & konstantinos, G. Covid-19 diaqnozu Təcili yardım şöbəsində: ağacı görərək meşəni itirir.Mouliou, DS, Ioannis, P. və Konstantinos, G. Covid-19 diaqnozu Təcili yardım şöbəsində: ağaca baxın, meşəni itirir.Mulaniou DS, ioannis P. və Təcili yardım otaqlarında KOVIDNOS G. COVID-19 diaqnozu: Ağaclar üçün kifayət qədər meşə yoxdur. Görünür. dərman. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angi, E. et al. Abbott Realtime SARS-COV-2 ASSay analitik və klinik fəaliyyətinin təsdiqlənməsi və təsdiqlənməsi. J. Klinik. Virus. 129, 104474. Https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afşar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Covid-19-dirkinin müxtəlif genom bölgəsindən olan beş astar dəsti, Adi RT-PCR tərəfindən təyin olundu. Mollaei, HR, Afşar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Adi RT-PCR tərəfindən virus infeksiyasının aşkarlanması üçün beş astar seti ilə müqayisə.Mollaei, HR, Afşar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. və Aflatunyan, B. Adi RT-PCR tərəfindən viral infeksiyanın aşkarlanması üçün beş pillə olan beş primerin müqayisəsi. Mollaei, HR, Afşar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. 比较来自 Covid-19 不同基因组区域的五个引物组, 用于通过常规 RT-PCR 检测病毒感染. Mollaei, HR, Afşar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Adi RT-PCR tərəfindən viral infeksiyanın aşkarlanması üçün Covid-19-un 5 fərqli genetik bölgəsinin müqayisəsi.Mollaei HR, Afşar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. və Aflatunyan B., Adi RT-PCR tərəfindən viral infeksiyanın aşkarlanması üçün Kovid-19 Genomun müxtəlif bölgələrindən beş astarın müqayisəsi.İran. J. Mikrobiologiya. 12 (3), 185 (2020).
Goertzer, i. et al. SARS-COV-2 Genome ardıcıllığının aşkarlanması üçün Milli Xarici Keyfiyyət Qiymətləndirmə Proqramının ilkin nəticələri. J. Klinik. Virus. 129, 104537. Https://doi.org/10.1016/J.JCV.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Şiddətli kəskin tənəffüs sindromu üçün beş RT-PCR dəstinin effektivliyinin analitik qiymətləndirilməsi Coronavirus 2. J. Klinik. Laboratoriya. anus. 35 (1), E23643 (2021).
Wang B. et al. Çində real vaxt polimeraz zəncirvari reaksiyasına (PCR) əsaslanan yeddi ticari SARS-COV-2 RNA aşkarlama dəstlərinin qiymətləndirilməsi. Klinik. Kimyəvi. Laboratoriya. dərman. 58 (9), E149-E153 (2020).
Van Casten, Pb et al. Yeddi kommersiya RT-PCR Covid-19 diaqnostik dəstinin müqayisəsi. J. Klinik. Virus. 128, 104412 (2020).
Lu, yu, et al. SARS-COV-2 nukleik turşularının aşkarlanması üçün iki PCR dəstinin diaqnostik performansının müqayisəsi. J. Klinik. Laboratoriya. anus. 34 (10), E23554 (2020).
Lefart, PR və s. Dörd SARS-COV-2 Nuklein turşusu gücləndirmə testinin (Naat) platformalarının müqayisəli bir araşdırması, xəstənin və nümunə növündən asılı olaraq şəxsiyyət vəsiqəsinin əhəmiyyətli dərəcədə pozulduğunu göstərdi. Diaqnoz. mikrobiologiya. Yoluxdurmaq. diss. 99 (1), 115200 (2021).
Abbott molekul. Abbott Real-Time SARS-COV-2 analiz paketi daxil edin. https://www.molecular.abbott/us/in/products/infectsous-disease/realtime-sars-2-assay. 1-12. (10 avqust 2020-ci il tarixinə) (2020).
Klein, S. et al. SARS-COV-2 RNTOLATION RT-QPCR və RT-lampa tərəfindən sürətli geniş miqyaslı aşkarlama üçün maqnit muncuq istifadə. Virus 12 (8), 863 (2020).