Prospektiv tədqiqatda irəliləyiş: PCR əsaslı qan ctDNA metilasyon texnologiyası kolorektal xərçəng üçün MRD nəzarətində yeni bir dövr açır

Bu yaxınlarda JAMA Oncology (IF 33.012), Fudan Universitetinin Xərçəng Xəstəxanasından professor Cai Guo-ring və Şanxay Jiao Tong Universiteti Tibb Məktəbinin Renji Xəstəxanasından professor Wang Jing tərəfindən KUNYUAN BIOLOGY ilə əməkdaşlıq çərçivəsində mühüm bir tədqiqat nəticəsini [1] dərc etdi: “Qaynayan şiş DNT Metilasiyası və Risk Stratifikasiyası vasitəsilə I-III mərhələ kolorektal xərçəng üçün molekulyar qalıq xəstəliyinin erkən aşkarlanması və risk təbəqələşməsi”. Bu tədqiqat, kolorektal xərçəngin təkrarlanmasının proqnozlaşdırılması və təkrarlanmasının monitorinqi üçün PCR əsaslı qan ctDNA çoxgen metilasiyası texnologiyasını tətbiq edən dünyada ilk çoxmərkəzli tədqiqatdır və mövcud MRD aşkarlama texnologiyası metodları ilə müqayisədə daha səmərəli texniki yol və həll təmin edir ki, bu da kolorektal xərçəngin təkrarlanmasının proqnozlaşdırılması və monitorinqinin klinik istifadəsini xeyli yaxşılaşdıracağı və xəstələrin sağ qalmasını və həyat keyfiyyətini əhəmiyyətli dərəcədə yaxşılaşdıracağı gözlənilir. Tədqiqat jurnal və onun redaktorları tərəfindən də yüksək qiymətləndirilmiş və bu sayda əsas tövsiyə sənədi kimi qeyd edilmişdir. İspaniyadan professor Juan Ruiz-Bañobre və ABŞ-dan professor Ajay Goel onu nəzərdən keçirmək üçün dəvət olunmuşdular. Tədqiqat həmçinin ABŞ-ın aparıcı biotibbi mediası olan GenomeWeb tərəfindən də işıqlandırılmışdır.

Kolorektal xərçəng (KXX) Çində mədə-bağırsaq traktının geniş yayılmış bədxassəli şişidir. Beynəlxalq Xərçəng Tədqiqatları Agentliyinin (IARC) 2020-ci il məlumatlarına görə, Çində 555.000 yeni hal dünyanın təxminən 1/3 hissəsini təşkil edir və Çində ümumi xərçəng xəstəlikləri arasında ikinci yerə yüksəlir; 286.000 ölüm dünyanın təxminən 1/3 hissəsini təşkil edir və Çində xərçəng ölümlərinin beşinci ən çox yayılmış səbəbi kimi qiymətləndirilir. Çində ölümün beşinci səbəbidir. Diqqətəlayiq haldır ki, diaqnoz qoyulmuş xəstələr arasında TNM I, II, III və IV mərhələləri müvafiq olaraq 18,6%, 42,5%, 30,7% və 8,2% təşkil edir. Xəstələrin 80%-dən çoxu orta və gec mərhələlərdədir və onların 44%-i qaraciyər və ağciyərlərdə eyni vaxtda və ya heteroxron uzaq metastazlara malikdir ki, bu da sağ qalma müddətinə ciddi təsir göstərir, sakinlərimizin sağlamlığını təhlükə altına alır və ağır sosial və iqtisadi yükə səbəb olur. Milli Xərçəng Mərkəzinin statistikasına görə, Çində kolorektal xərçəng müalicəsinin qiymətində orta illik artım təxminən 6,9%-dən 9,2%-ə qədərdir və xəstələrin diaqnozdan sonrakı bir il ərzində şəxsi sağlamlıq xərcləri ailə gəlirinin 60%-ni təşkil edə bilər. Xərçəng xəstələri xəstəlikdən əziyyət çəkir və eyni zamanda böyük iqtisadi təzyiq altındadırlar [2].
Kolorektal xərçəng lezyonlarının doxsan faizi cərrahi yolla çıxarıla bilər və şiş nə qədər tez aşkar edilərsə, radikal cərrahi rezeksiyadan sonra beş illik sağ qalma nisbəti bir o qədər yüksək olar, lakin radikal rezeksiyadan sonra ümumi residiv nisbəti hələ də təxminən 30% təşkil edir. Çin əhalisində kolorektal xərçəngin beş illik sağ qalma nisbəti I, II, III və IV mərhələlər üçün müvafiq olaraq 90,1%, 72,6%, 53,8% və 10,4% təşkil edir.
Minimal qalıq xəstəlik (MRD) radikal müalicədən sonra şişin təkrarlanmasının əsas səbəbidir. Son illərdə bərk şişlər üçün MRD aşkarlama texnologiyası sürətlə inkişaf etmişdir və bir sıra ağır müşahidə və müdaxilə tədqiqatları əməliyyatdan sonrakı MRD statusunun kolorektal xərçəngin əməliyyatdan sonrakı təkrarlanma riskini göstərə biləcəyini təsdiqləmişdir. ctDNA testinin invaziv olmayan, sadə, sürətli, yüksək nümunə əlçatanlığı və şiş heterojenliyini aradan qaldırmaq kimi üstünlükləri var.
ABŞ-ın yoğun bağırsaq xərçəngi üzrə NCCN təlimatlarında və Çinin yoğun bağırsaq xərçəngi üzrə CSCO təlimatlarında əməliyyatdan sonrakı residiv riskinin müəyyən edilməsi və yoğun bağırsaq xərçəngində adyuvant kimyaterapiya seçimi üçün ctDNA testinin II və ya III mərhələ yoğun bağırsaq xərçəngi olan xəstələr üçün adyuvant müalicə qərarlarına kömək etmək üçün proqnostik və proqnozlaşdırıcı məlumatlar təmin edə biləcəyi bildirilir. Bununla belə, mövcud tədqiqatların əksəriyyəti mürəkkəb bir prosesə, uzun müddətə və yüksək qiymətə malik [3], ümumiləşdirmə qabiliyyətinin azlığına və xərçəng xəstələri arasında aşağı yayılmaya malik yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllıq texnologiyasına (NGS) əsaslanan ctDNA mutasiyalarına yönəlmişdir.
III mərhələ kolorektal xərçəng xəstələrində NGS əsaslı ctDNA dinamik monitorinqi tək bir müayinə üçün 10.000 dollara qədər başa gəlir və iki həftəyə qədər gözləmə müddəti tələb edir. Bu tədqiqatda istifadə edilən çoxgenli metilasiya testi olan ColonAiQ® ilə xəstələr qiymətin onda birinə dinamik ctDNA monitorinqindən keçə və cəmi iki gün ərzində hesabat ala bilərlər.
Çində hər il qeydə alınan 560.000 yeni kolorektal xərçəng hadisəsinə görə, əsasən II-III mərhələ kolorektal xərçəngi olan klinik xəstələrdə (nisbət təxminən 70%) dinamik monitorinqə daha çox tələbat var, lakin kolorektal xərçəngin MRD dinamik monitorinqinin bazar həcmi hər il milyonlarla insana çatır.
Tədqiqat nəticələrinin mühüm elmi və praktik əhəmiyyətə malik olduğu görünür. Genişmiqyaslı perspektivli klinik tədqiqatlar vasitəsilə PCR əsaslı qan ctDNT çoxgenli metilasyon texnologiyasının həm həssaslıq, həm vaxtında, həm də səmərəli şəkildə kolorektal xərçəngin təkrarlanmasının proqnozlaşdırılması və təkrarlanmanın monitorinqi üçün istifadə edilə biləcəyi təsdiqlənib və bu da dəqiq tibbin daha çox xərçəng xəstəsinə fayda verməsinə daha yaxşı imkan yaradır. Tədqiqat, KUNY tərəfindən hazırlanmış və erkən müayinə və diaqnozda klinik tətbiqi mərkəzi klinik tədqiqatla təsdiqlənmiş kolorektal xərçəng üçün çoxgenli metilləşmə testi olan ColonAiQ®-a əsaslanır.
2021-ci ildə mədə-bağırsaq xəstəlikləri sahəsində aparıcı beynəlxalq jurnal olan Gastroenterology (IF33.88), Fudan Universitetinin Zhongshan Xəstəxanası, Fudan Universitetinin Xərçəng Xəstəxanası və digər nüfuzlu tibb müəssisələrinin KUNYAN Biological ilə birlikdə çoxmərkəzli tədqiqat nəticələrini təqdim etdi. Bu nəticələr ColonAiQ® ChangAiQ®-nin kolorektal xərçəngin erkən müayinəsi və erkən diaqnozunda əla performansını təsdiqlədi və əvvəlcə kolorektal xərçəngin proqnoz monitorinqində potensial tətbiqini araşdırdı.

I-III mərhələ kolorektal xərçəngdə risk stratifikasiyasında ctDNA metilləşməsinin klinik tətbiqini, müalicə qərarlarına rəhbərlik etməyi və erkən residiv monitorinqini daha da təsdiqləmək üçün tədqiqat qrupuna radikal əməliyyat keçirmiş və əməliyyatdan bir həftə əvvəl, əməliyyatdan bir ay sonra və dinamik qan ctDNA testi üçün əməliyyatdan sonrakı adyuvant terapiyada hər bir müşahidə nöqtəsində (üç ay ara ilə) qan nümunələri toplayan I-III mərhələ kolorektal xərçəngli 299 xəstə daxil edilmişdir.
Əvvəlcə, ctDNA testinin kolorektal xərçəng xəstələrində residiv riskini həm əməliyyatdan əvvəl, həm də əməliyyatdan sonrakı erkən dövrdə proqnozlaşdıra biləcəyi aşkar edilmişdir. Əməliyyatdan əvvəlki ctDNA-pozitiv xəstələrdə əməliyyatdan sonrakı residiv ehtimalı əməliyyatdan əvvəlki ctDNA-neqativ xəstələrə nisbətən daha yüksək idi (22.0% > 4.7%). Əməliyyatdan sonrakı erkən ctDNA testi yenə də residiv riskini proqnozlaşdırdı: radikal rezeksiyadan bir ay sonra ctDNA-pozitiv xəstələrdə residiv ehtimalı mənfi xəstələrə nisbətən 17.5 dəfə çox idi; komanda həmçinin aşkar etmişdir ki, ctDNA və CEA testlərinin birləşməsi residivin aşkarlanmasında performansı bir qədər yaxşılaşdırmışdır (AUC=0.849), lakin fərq tək ctDNA (AUC=0.839) testi ilə müqayisədə əhəmiyyətli deyildi. Fərq tək ctDNA ilə müqayisədə əhəmiyyətli deyildi (AUC=0.839).
Klinik mərhələləşmə hazırda xərçəng xəstələrinin risk təbəqələşməsinin əsas əsasını təşkil edir və mövcud paradiqmada çox sayda xəstə hələ də residiv verir [4] və klinikada həddindən artıq müalicə və qeyri-kafi müalicənin yanaşı mövcud olması səbəbindən daha yaxşı təbəqələşmə vasitələrinə təcili ehtiyac var. Buna əsaslanaraq, komanda III mərhələ kolorektal xərçəngi olan xəstələri klinik residiv riskinin qiymətləndirilməsinə (yüksək risk (T4/N2) və aşağı risk (T1-3N1)) və adyuvant müalicə müddətinə (3/6 ay) əsasən müxtəlif alt qruplara təsnif etdi. Təhlil göstərdi ki, ctDNA-pozitiv xəstələrdən ibarət yüksək risk alt qrupundakı xəstələr altı aylıq adyuvant terapiya aldıqda residiv nisbətinin daha aşağı olduğunu göstərir; ctDNA-pozitiv xəstələrdən ibarət aşağı risk alt qrupunda adyuvant müalicə dövrü ilə xəstə nəticələri arasında əhəmiyyətli bir fərq yox idi; ctDNA-neqativ xəstələrdə ctDNA-pozitiv xəstələrə nisbətən proqnoz xeyli yaxşı idi və əməliyyatdan sonrakı residivsiz dövr daha uzun idi (RFS); I mərhələ və aşağı riskli II mərhələ kolorektal xərçəng Bütün ktDNT-mənfi xəstələrdə iki il ərzində residiv müşahidə olunmadı; buna görə də, ktDNT-nin klinik xüsusiyyətlərlə inteqrasiyasının risk təbəqələşməsini daha da optimallaşdıracağı və residivi daha yaxşı proqnozlaşdıracağı gözlənilir.

Şəkil 1. Kolorektal xərçəngin residivinin erkən aşkarlanması üçün POM1-də plazma ctDNT analizi
Dinamik ctDNA testinin sonrakı nəticələri göstərdi ki, müsbət dinamik ctDNA testi olan xəstələrdə residiv riski qəti müalicədən sonra (radikal cərrahiyyə + adyuvant terapiyadan sonra) xəstəliyin residiv monitorinq mərhələsində mənfi ctDNA olan xəstələrə nisbətən əhəmiyyətli dərəcədə yüksəkdir (Şəkil 3ACD) və ctDNA şişin residivini görüntüləmədən 20 aya qədər tez göstərə bilər (Şəkil 3B), bu da xəstəliyin residivini erkən aşkarlamaq və vaxtında müdaxilə etmək imkanı yaradır.

Şəkil 2. Kolorektal xərçəngin residivini aşkar etmək üçün uzununa kohorta əsaslanan ctDNT analizi

“Kolorektal xərçəngdə çox sayda translyasiya tibb tədqiqatı bu sahəyə rəhbərlik edir, xüsusən də ktDNT əsaslı MRD testi residiv riskinin təbəqələşdirilməsini təmin etməklə, müalicə qərarlarına rəhbərlik etməklə və erkən residiv monitorinqini aparmaqla kolorektal xərçəng xəstələrinin əməliyyatdan sonrakı idarə olunmasını yaxşılaşdırmaq üçün böyük potensiala malikdir.”

Mutasiya aşkarlanması ilə müqayisədə yeni MRD marker kimi DNT metilasyonunun seçilməsinin üstünlüyü ondan ibarətdir ki, o, şiş toxumalarının bütün genom ardıcıllığı müayinəsini tələb etmir, birbaşa qan analizi üçün istifadə olunur və normal toxumalardan, xoşxassəli xəstəliklərdən və klonal hematopoezdən qaynaqlanan somatik mutasiyaların aşkarlanması səbəbindən yalançı müsbət nəticələrdən qaçınır.
Bu tədqiqat və digər əlaqəli tədqiqatlar təsdiqləyir ki, ctDNA əsaslı MRD testi I-III mərhələ kolorektal xərçəngin təkrarlanması üçün ən vacib müstəqil risk faktorudur və adyuvant terapiyanın "gərginləşməsi" və "aşağı salınması" da daxil olmaqla, müalicə qərarlarına istiqamət verməyə kömək etmək üçün istifadə edilə bilər. MRD I-III mərhələ kolorektal xərçəng üçün əməliyyatdan sonra təkrarlanma üçün ən vacib müstəqil risk faktorudur.
MRD sahəsi epigenetikaya (DNT metilasiyası və fraqmentomika) və genomikaya (ultra dərin hədəflənmiş ardıcıllıqla və ya bütün genom ardıcıllığı ilə) əsaslanan bir sıra innovativ, yüksək həssas və spesifik analizlərlə sürətlə inkişaf edir. ColonAiQ®-un genişmiqyaslı klinik tədqiqatlar təşkil etməyə davam edəcəyini və əlçatanlığı, yüksək performansı və əlverişliliyi birləşdirən və adi klinik praktikada geniş istifadə edilə bilən MRD testinin yeni bir göstəricisinə çevrilə biləcəyini gözləyirik.
İstinadlar
[1] Mo S, Ye L, Wang D, Han L, Zhou S, Wang H, Dai W, Wang Y, Luo W, Wang R, Xu Y, Cai S, Liu R, Wang Z, Cai G. Qan dövranı şişinin DNT metilləşməsi yolu ilə I-III mərhələ kolorektal xərçəng üçün molekulyar qalıq xəstəliyinin erkən aşkarlanması və risk təbəqələşməsi. JAMA Oncol. 2023 Aprel 20.
[2] “Çin əhalisində kolorektal xərçəng xəstəliyinin yükü: son illərdə dəyişibmi?”, Çin Epidemiologiya Jurnalı, Cild 41, № 10, Oktyabr 2020.
[3] Tarazona N, Gimeno-Valiente F, Gambardella V və b. Lokallaşdırılmış yoğun bağırsaq xərçəngində minimal qalıq xəstəliyin izlənməsi üçün qan dövranında olan şiş DNT-sinin hədəflənmiş növbəti nəsil ardıcıllığı. Ann Oncol. 1 Noyabr 2019;30(11):1804-1812.
[4] Taieb J, André T, Auclin E. Metastatik olmayan yoğun bağırsaq xərçəngi üçün təkmilləşdirilmiş adyuvant terapiya, yeni standartlar və perspektivlər. Cancer Treat Rev. 2019;75:1-11.